朱翊钧选择海瑞这个严格而又有能力的大理寺卿，使得巡回法庭成为大明最为风清气正、冤假错案最少的司法机构。截止万历九年底，八个巡回法庭已经在大明各省走了一个大圈，共纠正冤案六千八百余起，断案三万七千余例，总结整理了各种典型案例一千四百三十个，并促使朝廷修改《大明律》具体条文一百五十余处。
出于对司法权力制衡的考虑，皇帝并未授予巡回法庭在纠正错案的过程中以督查官员之权。但巡回法庭每纠正一个错案，必须将其中可能存在的**线索，按照该官员的被管理权限，移送给两京都察院或地方按察司。
而巡回法庭移送的线索，都察院和按察司是必须给皇帝一个说法的，相应的报告必须移送巡回法庭签阅。如此一来，就在案件纠察工作上形成一个完整的闭环，在海瑞的监督下，闭环各个环节上的魑魅魍魉都被反复涤荡。
巡回法庭所到之处，大量冤假错案被纠正，与之相关的**官员一串串、一窝窝的被随之而来的都察绳之以法。
效果非常显著，从万历七年开始，大明的吏治就为之一清。大量冤假错案造成的民怨得到极大缓解，“官府衙门八字开，有理无钱莫进来”的情况也得到了很大纠正。
在朱翊钧授意下，**官员一旦被查实，两京各大报纸一般都会连发几篇文章，将之彻底的钉在耻辱柱上。在以“孝”治国的国度里，此类曝光对当事人的打击是致命的，是真正的社会性死亡。
后世的史学家研究，海瑞建立的巡回法庭绝不仅仅是法庭，而是掌握在朱翊钧手中的反**利器。海瑞如同一柄绝世的神兵，其凛冽寒光所照，大明先是出现了点点净土，随即这些净土连接成片，终于还给百姓一个朗朗晴天。后世的社会学家据此还发明了一个词儿，叫做“海瑞效应”。
万历十年初，在南京巡回法庭总署过了年的海瑞再次出动，须发皆白的海青天出巡的第一站即放在杭州。因为万历十年的冬天，杭州下了一场历年罕见的大雪。大量仍相信天人感应的杭州市民，都在传说杭州一定是出现了大的冤案。
海瑞本人不相信天人感应之说，他尽管已经古稀之年，但因把学习当做重要的修身原则，一直能跟上形势。他不仅不是一个食古不化的倔头，还是一个与时俱进的能臣。报纸上普及的格物知识，海瑞是每期不落全看的。而且，他还紧跟时髦做剪报。
虽然不信天人感应之说，但民有所呼，我有所应。海瑞本来就打算在万历十年初就带着第三巡回法庭出巡，将第一站选在杭州也就是顺便——万历九年底，相关文函就被送到浙江布政使司，通知海大人明年第一站到杭州。
他这一顺便不要紧，浙江布政使司的巡抚衙门、布政司、按察使和杭州知府以及所有县官春节都没过好，连续加班复核三年以来所有司法案件。凡是海瑞巡回法庭管辖范围内的各类文案，都列出整改条目进行自查。
按照浙江巡抚吴善言的说法：“自查自纠尽管有失官僭，但在海大人面前至少争取有一个好态度！不管是谁，胆敢掉链子，老子剥了你们的皮！”当然，吴巡抚并不能剥谁的皮，这里是将掉链子官员官衣剥掉的意思。巡抚要参自己的下属，那还是一参一个准的。
经过连续两个月的精心准备，杭州终于达到了海晏河清的境界。万历十年二月初三，到达杭州的巡回法庭放出告牌之后，法庭门外门可罗雀。
海瑞开始时还怀疑是不是杭州地方把进法庭的路给封了——此前就有个愚蠢的地方官这样干过，还有的地方官安排人在海瑞面前“演官司”哩。他派了好几拨人出去查看，结果反馈回来的消息是杭州市面一切如常，街头巷尾打听的结果是年节前后，整个浙江把积案都判决了，所有司法案件又复核了一遍。
海瑞哑然失笑，也不以浙江布政司这样做为忤。海瑞觉得如果在自己有生之年能让所经之地青天朗朗，那将是对他最大的褒奖，海刚峰死而无憾！