军队的编制体制规模发生了重大变化，战争出现了许多新的特点，作战指挥日趋复杂。原先三合一的简单机构已经不能适应战争的需要，指挥体制必须变革。
拿破仑一生打了几十个战役，到了后期也感到无法统帅全军了。
在1807年他任命曾在意大利方面参谋长的贝蒂埃为自己的参谋长。
贝蒂埃对参谋工作颇有研究，曾著有《阿尔卑斯普通参谋业务纲领》一书。
贝蒂埃经过一番潜心研究，向拿破仑提出了建立参谋处的设想，得到了拿破仑的支持。
1812年世界上第一个专门辅助统帅实施作战指挥的参谋处产生了，作战指挥较好地适应了当时战争的需要。
参谋处有参谋长领导，下设四科。第一科主管军队编制和实力，组织部队移动和检阅，搜集制定军法，处理战俘和逃兵等。第二科主管部队装备。第三科主观侦察，制订作战计划，组织通信联络和内务勤务。
随着军队指挥的实施，司令部体制逐渐完善起来。
18至19世纪的欧洲兵制改革，实质上是武装力量从私人化向国家化的转变，军队实质上只是君主或领主的个人私兵而已，这个转变是从“征兵制”的启用开始的。
真正的革命性变化来自法国大革命，王室被推翻，已没有“国王的军队”这个名份，而在反法同盟的围攻下，战争性质转变为“为保卫祖国”而进行的“人民战争”，不是为了骑士的荣耀，也不是为了赚钱，作为国家公民都有从军义务，这个转变其实很仓促，完全是迫于形势，在“爱国主义”的精神感召下的自发行为。
通过法国大革命，所谓“民族国家”的理念开始占主导地位，国家的军队也即“人民军队”。
总之，从法国大革命到拿破仑时代，军队逐渐完成了向资产阶级军队的演变。
在兵役制上，由雇佣兵制为主转向了义务兵役制，基本实现了兵役面前人人平等的资产阶级原则，拿破仑一世改造了法国革命所建立的军队，实行了普遍义务兵役制，建立了由步兵、骑兵和炮兵组成的师和军，并且组建了强大的预备队。
拿破仑在战争实践中，始终把建设军队的问题摆在重要的位置，并力求建立一支能征善战的强大的资产阶级军队。
“欲治兵者，必先选将”。
拿破仑有一句名言：一支由驯鹿统帅的狮军，决不可能再是狮军。
并由此把将帅的选拔作为建立强大军队的重要条件。
在如何选拔将帅的问题上：他敢于起用新人，给年轻军官创造机会。
据悉1805年由他晋封的18位元帅，多数在40岁以下，37岁以下的约有7人，而达武仅34岁。
同时，彻底破除了传统的讲究贵族出身的门阀观念，注重唯才是举。
这就是拿破仑的选帅标准：即注重年轻有为；力求不拘一格和强调素质才能。
“不想当元帅的士兵不是好士兵”。他曾说：“每个士兵的背囊里都有一根元帅的指挥棍”。提倡人人争当将军和元帅。
从1796年意大利战争开始，拿破仑就深刻体会到，决定战争胜负的主要是精神力量，而不是数量。