承慈亲自将蚩尤的尸身送入了轮回。天下安定国泰民安，轩辕带着妻子开始巡查天下，没有想到嫘祖因为长年劳累，死在归来的路上，嫘祖的去死给轩辕得触动很大，想到现在人族寿命都不长，轩辕觉得应该做点什么？他想到了之前广成子等人来的时候给他的《自然经》说是可以延年益寿，当时他还没有什么感觉，毕竟有原始传下的玉清功法，未曾想到现在却是派上用场。但是玉清一脉择徒甚严，他也不敢把玉清功法私自传下。
轩辕回去拿出《自然经》打算认真研究一番，便把政事托付给自己的孙子高阳，也就是后来的颛顼帝。说起自己的孙子，轩辕那是无比的满意，万分高兴，高阳是他二子昌意之子，从小上尊下敬很是乖巧，上回三教弟子前来，还被多宝道长收为记名弟子，虽然只是记名但是也让族人欢喜很久，轩辕更是高兴，他家出了二个圣人门下，如何不是好事？就是辈分有点乱，但是轩辕决定忽视这小小的问题。
交托了政事后，轩辕一门心思研究《自然经》几年后也有点收获，但是很多地方还是很疑惑，如今三教弟子已经各自回了山门。虽然时常听闻人族各部落有圣师的消息，但也是神龙见首不见尾，实在也是难以寻得。而今部落中仙家修为最高的应该表示九天玄女了。
说也奇怪啊，人族统一这么多年了，其他天兵天将都回天庭复命去了。只有九天玄女娘娘还一直就在人族中。而且人美心善，这些年实在是帮助了人族诸多，自己去求娘娘要的长生之术想必娘娘不会拒绝的吧。黄帝如此想着，不知为何内心一股火热。
如此轩辕便将洪荒一干大小事宜交于他人打礼，自己闭关与玄女修习那长生不老之术。玄女得昊天王母之命前来教导轩辕，自然不敢藏私，只尽心尽力将心中学全部教与轩辕！轩辕进展更是神速！轩辕本就是聪慧之人，结合自己身体，常常能举一反三，旁通触类，如此一来，轩辕又在玄女所教地基础上领悟到了许多新的东西。
时间自是流得飞快，如此却是十年已过，轩辕终将修仙之道习至大成，由一普通凡人进入到地仙境界，倒也真算得上是长生不老了！
轩辕在修习了玄女长生不老之道后，心中感悟也是一天朗，轩辕心道：“天皇伏羲给洪荒众人留下了伏羲八卦，地皇神农留下了《神农本草经》，之后两人证就大道。如此看来，我的功德途径当在此长生不老之术上了！”
轩辕久为人族共主，做事魄力自是异于常人，当下便又继续闭关五年，终于写成了那本后世称为三大奇书之一的《黄帝内外经》。
《黄帝内外经》又分为《内经》和《外经》。《内经》又分为《素问》和《灵枢》两大部分，一共为八十一篇，讲的是人体调养、治疗、修身养性之事；《外经》也分为两大部分，为《祝由科》与《长生卷》，共三十七篇，《祝由科》讲的是起死回生之术，《长生卷》则是包含修仙之法，长生不老之道。
《黄帝内外经》大成，轩辕却没有出现预想中的那种通灵，反而是手拿着《黄帝内外经》在那琢磨：自己得道之途当在此举之上，为何自己心中却是隐隐觉得不妥？
轩辕却是无论如何也想不出哪里不妥，只能先出得关来。《黄帝内外经》也就因此耽误下来，不能问世！
如此又是过了一年有余，轩辕看着身边那些追随自己一起风风雨雨过来的老臣子一个个的离自己而去，自是心急如焚。偏生心急吃不得热豆腐，轩辕愈是着急，愈是一点头绪也无。
这一日。轩辕在一洪荒百姓家中探访，却是见那户百姓正在烧香祭拜圣人画像，突的轩辕心中一动，却是想起了当日请教圣师灭蚩尤之时还留有一幅画像在自己手中。
原来自从轩辕打败蚩尤之后，洪荒再无大事发生。寻常事情自然也不用劳动蚩尤大驾了，因此，轩辕只将画像交由宫人日夜好生祭拜。后来轩辕闭关十五年写那《黄帝内外经》，却是将此事忘得差不多了。
轩辕回到宫中，沐浴更衣。向着画像焚香祭拜。