清军再差也不可能像明朝那样一年之内收税三次，共计五年的赋税，还纵容海盗乱兵抢掠。显然，除了大规模的屠杀，很难能比明军表现更差了。
在全员恶人的情况下，广东百姓和南方其他地方的百姓一样，选择了一个不太混蛋的混蛋，也让光复广东变成了一种奢望。
清军与联军像是两个进行了几个回合的拳击手一样，纷纷回到属于自己的角落休整，准备一下轮的战斗，既然大规模的休战成为了既定事实，那就有时间和空间进行对军队进行改制和整顿。
先是权柄，林士章从广东巡抚沦落为粤西巡抚，只有粤西四府和肇庆一块小地盘在掌握之中，但权柄却是更重，在绍武和永历相争的时间，林士章就在社团的支持下对琼州和雷州的官将进行大换血，大量林姓、海姓的文官执掌了二州行政财政，而二州辖制内卫所和将帅也被黄蜚的义子和袁时中的把兄弟控制，可以说，琼雷二州已是自成一体的藩镇，而林士章显然还不满足，在成为广东巡抚之后，廉州、高州也在控制之中，林士章不仅要扩大地盘还要更大的权柄。
林、黄、袁三人已经形成了一个巨大的政治军事联盟，林士章直接向瞿式耜讨要任命官员和将领的大权，目的就是让粤西这块地盘针插不入，水泼不进，用林士章的话来说，他要按照自己的节奏自己的判断去抗清，不受任何人的影响。
瞿式耜对琼雷二州也有了解，林士章有大义名分也有军事力量支持，已经在二州清理了军屯，强迫大户缙绅上缴往年欠税，可谓大权独揽，瞿式耜想改变这一切也是晚了，而黄蜚更是暗示，在永历这里得不到的东西，可以在鲁监国那里得到。
最终，瞿式耜选择了妥协，给了林士章想要的一切，粤西事实上藩镇一方，宛若一个小朝廷，除了名义上尊奉永历皇帝，每年给永历朝廷三万两白银的赋税，其余完全自主，而正是这样一个政策自主的独立王国，则是社团愿意合作的对象。
按照李明勋规划，既然明军处于守势，那么就不会把主要的兵力投放在这里，在规划中，社团在广东投入九个营，其中三个步兵营，一个6战营，两个守备营，一个开拓营和两个炮兵营，共计一万五千左右的兵力，囊括了粤西、香港和琼州三条战线，香港依旧是两个守备营，步兵炮兵各一个营的规模，而琼州则有一个开拓营在五指山中抓捕生黎，稳定地方局势，为石碌铁矿人手，高锋则主管粤西防线，麾下两个步兵营和6战、炮兵各一个营，但是李明勋把本土来的两个新营伍安插起来，把两个精锐营伍带回本土休整。
在粤西，社团有七千人马和一支驻守海陵岛的分舰队，而明军则比较惨，当初洪天擢带来的广西兵只留下了两千人，其余归属林察，要去郁林州，即便逃窜到高州、罗定一带的惠州总兵李士琏率军来投，带来了两千人，但精兵也只有七千，好在林士章动员了一批卫所兵加入其中，使得正兵过万，有招募了五千义勇助战，让粤西防线总兵力达到了两万余。
从阵线上来看，精锐的社团6军镇守前线，6战营与分舰队驻守海陵岛，6军两个营和两千义勇、一千正兵驻守阳江县城，前线士卒的粮饷由社团供给，所有明军，无论义勇还是正兵，都按照社团最低的下等兵饷银，月饷二两，吃食用度由军需供给，这消息一出，很多明军都愿意前来。
明军与6军并肩作战久了，对社团精兵待遇极为艳羡，虽说没有出战、开拔等银子，但每次饷银是统帅部的军官亲自到手里，武器精良不说，平日吃用也是极好，顿顿有肉，隔三差五的还有酒水犒劳，当初在广州，很多明军想前来投靠，但都不被接纳，有些索性脱了身上的明军军服，跑到劳工营里，至少弄了不少油水填饱肚子。