做了一些手脚让瑞定位器出问题。
而另一方面，运输过程中被商都金蝰蛇集团罗烈劫机，后主角被两个变种人诺瓦和米娅所救，之后原著主角瑞在商都废弃区跟追风部队冰糖心相遇，与来抓博他的亚人托瑞斯战斗，将其击败后的主角瑞按照赫雅嘱托跟着被联合军雇佣的追风部队去找联合军商都总部首领夏克。
而赫雅埃达斯由于这个原因被阿萨抓回空间站问斩，主角瑞为了救出赫雅而不断努力，与联合军联合攻向阿斯加特亚人空间站。
与此同时金蝰蛇为了得到纳米尖兵的秘密，计划让那两个被抓到的变种人去救下被押送的赫雅，最后遇到一个空飞船，还遇到另一个培植型纳米尖兵ga18，金蝰蛇部队被其狂虐一顿死了一堆人。
而得到消息的联合军接到最高首领的信息，也有计划劫持这艘飞船，最后同样劫持了个寂寞。
最后主角团跟联合军攻上阿斯加特，经过一系列战斗，发现亚人最高首领跟联合军最高首领其实是同一个人。
而元星上的各势力不论是联合军或者亚人，目的都是为了元星人类的延续，差不多是一群为了同样的目标但是过程不一样，而产生理念冲突的故事。
很有意思，整个世界观在作者君看来是这样大家都为了各自理念各自理想在努力，没有绝对对与错。
世界观还不错，不是无脑对与错的动漫，有兴趣可以看看。
有点乱，简单来说就是
亚人知道整个元星都在一个2型文明的阴影下，他们一切科技都来自于这个文明。所以他们目标是方舟计划，戴上人类基因和少数优秀人，摄取资源能源逃离元星。
联合军的最终目标也是为了元星全人类，只是不认同亚人做法。
金蝰蛇集团开始不明白圣柜的真实面目，以为圣柜无所不能罗烈是为了复活他老婆。
变种人部落则是为了生活过的更好。变种人可以参考x战警，但是这里的变种人形成原因是圣柜逸散出来的紫雾辐射造成的，顺带一提，盖洛斯就是紫雾辐射变异物种。
而其他愚昧的人认为圣柜就是神物。
好了。罗里吧嗦说一大堆，也不知道对没看过纳米核心的人有没有帮助，写的不好请见谅。
阿萨亚人牛逼轰轰，科技发达。主要文字纳米文
金蝰蛇如其名，地头蛇。主要文字甲骨文、小篆、中文
联合军如其名。主要文字英文
变种人部落形式落后村庄，，