司徒王允带着汉献帝刘协逃上宣平城门，躲避乱兵，李傕等在城门下伏地叩拜。刘协斥责李傕等人放纵士兵在长安城内行凶，意欲何为。
李傕等人表示自己不敢叛逆，但是董卓忠心朝廷却被王允、吕布等人无端杀害，他们此举就是为董卓报仇，事后任凭朝廷降罪。
王允势穷力孤，被迫出来见了李傕。同年六月，李傕自任扬武将军，郭汜为扬烈将军，樊稠等人为中郎将。
起初，王允任命同郡人宋翼为左冯翊，王宏为右扶风。李傕等人想要诛杀王允，又恐二郡起兵反抗，于是便先征召宋翼和王宏入朝。
王宏派使者向宋翼表示，只因他们二人如今身在外郡，李傕等人材不敢加害王允，要是他们接受征召，恐怕明天就会遭到屠灭全族。
宋翼认为福祸难料，但是王命不可违抗。王宏提议既然董卓已经被诛，他的党羽也不难制伏，现在关东义军士气沸腾，倘若起兵与关东义军共同讨伐李傕，则有可能转祸为福。
但是宋翼没有听从，王宏亦不能独立成事，两人只能一同接受了征召。
初平三年（公元192年）六月初七，李傕逮捕并处死了王允和宋翼、王宏，以及王允妻子宗族在内的十余人，李傕还将王允曝尸于街市示众，并去收敛董卓的尸骨，安葬在郿县。
同年九月，李傕自任车骑将军，封池阳侯，兼任司隶校尉，假节。郭汜任后将军，封美阳侯；樊稠任右将军，封万年侯。李傕与郭汜、樊稠共掌朝政。
陇西将领韩遂、马腾归降朝廷，率领部属来到长安。朝廷任命韩遂为镇西将军，驻守凉州；任命马腾为征西将军，驻扎郿县。
兴平元年（公元194年）二月，马腾有私事求助李傕，李傕却没有帮忙。马腾大怒，想要发兵攻打李傕。汉献帝派出使者从中调解，马腾不从。
韩遂率部来为马腾和李傕调解，不久与马腾联合。侍中马宇、谏议大夫种邵以及左中郎将刘范等人暗中谋划，打算让马腾率军突袭长安，他们在城中作内应，联合消灭李傕等人。
就在马腾进兵到长安北面长平观时，马宇等人的计划泄露，仓皇出逃到槐里县
樊稠率兵迎击马腾，马腾战败，退回凉州。樊稠又乘势向槐里进攻，杀死马宇等人。
董卓刚死的时候，长安周围的三辅地区还有几十万户百姓，后来李傕等放纵士兵掠夺百姓，再加上饥荒，两年之间，百姓逃亡，荒无人烟。
那时朝廷刚刚迁都长安，许多宫人都没有衣服穿，汉献帝刘协想要拿出一批朝廷的布料，赏赐给宫人及大臣等制衣，李傕不许。
汉献帝于是诏令卖掉百余匹马，御府大司农也拿出两万匹布，准备将这些钱和布匹送给公卿大臣以及贫民。
但是李傕却以储备不足为由，把这些东西全部搬到了自己的军营中，据为己有。
兴平二年（公元195年）正月，李傕、郭汜、樊稠三人因为争功夺权，屡次想要互相攻击。
贾诩规劝他们顾全大局，他们各自心里虽然不想和好，但还是在表面上相互容忍。
当初樊稠攻打马腾、韩遂之时，李傕的侄子李利作战不力，受到樊稠斥责。等到马腾、韩遂败走，樊稠追击，韩遂向樊稠表示两人所争是王家之事，作为同乡，理应和谈。
于是双方各自退军，在阵前把臂交谈，很久才分别。李利回去后禀报李傕，称韩遂与樊稠曾在马上长谈，情意密切，李傕因此对樊稠生出疑心。
樊稠又想率兵往东出关，向李傕请求增加军队。同年二月，李傕便假借商议出兵之事请来樊稠，设计将他杀死，又吞并其部众。此后，将士之间互相猜忌。
李傕时常在家中宴请郭汜，又常让他留宿家中。郭汜的妻子担心丈夫爱上李傕的婢妾，便开始想方设法离间二人。
适逢李傕派人送来食物，郭汜的妻子就把豆豉说成是毒药，拿出来给郭汜看，还表示一个鸡窝容纳不下两只公鸡，郭汜不该完全信任李傕。
后来李傕再次宴请，郭汜喝得大醉，怀疑酒中有毒。此后李傕与郭汜两人生出嫌隙，举兵在长安城内互相攻击。
汉献帝派人为李傕和郭汜调解，二人没有听从。郭汜还计划将汉献帝迎入自己的军营之中，夜里有人逃跑，向李傕告密。