当阿克巴大帝发现无法顺利击败南疆军而暂时退回阿格拉修整之后，皇帝派出的无数密使开始来往于这些孟加拉偏僻地区。他们联络到了大大小小各路“扎米纳德”，劝说他们为了帝国与他们自身的利益反对南疆军的占领。
这并不困难，因为“扎米纳德”可以藉由帝国的制度享有政治、经济、军事方面的种种特权，而这些特权却不是南疆军能给予的至少高务实目前并未给高渊、刘馨这样大的自由裁量权。
这样一来，除了几座大城市之外，南疆军对孟加拉的占领就逐渐陷入被动。不多时，各地就开始上演“处处狼烟”的戏码。虽说这些反对者的力量单独来看都不算大，可正如苍蝇多了一样，虽然无法对人直接造成严重伤害，却能十足的恶心你。
南疆军从一开始习惯于出动协级规模的平叛军，逐渐降低到标，然后降低到营，最后降低到连也就是从出动数千到出动千余，再降低到出动三百，最后竟然开始每次只出动百余人。
不过，虽然单支平叛兵力一降再降，可是出动的次数却是日益增多。以至于曾有一日，刘馨在一天之内批准出动了五十三支平叛部队，搞得她不厌其烦，最后只能将此权力临时下放，由标一级的指挥主官也就是标统来决定。
按照这一临时规定，除非发现此次叛乱者拥众过万，否则不必上报远征军司令部，由各部队按照驻地或临时战区辖地原则自行解决。
终于空出时间来的刘馨并没有就此清闲下来，她的工作是所有人中最为繁忙的，一方面是以副司令身份实际主管军务，一方面又因为是“秘书长亲临战区”，毫无疑问地也得负责其他政务，真个是“上马管军，下马管民”了。
这一日，她正在查看最新上报的莫卧儿帝国军事制度简报。这份简报不同于以往细作们东一言西一语的报告，它比较详细的归纳汇总了莫卧儿的军事制度，然后还考虑到了远征军高层事务繁忙的问题，另外给了一份简要概述。
这份概述很符合刘馨此刻的需求，因为她确实太忙了。根据这份简报概述，内务部间谍司归纳了莫卧儿帝国军事制度的几个关键特点
其一，马尼普军制。马尼普军制是莫卧儿帝国军事组织的核心。在这一制度下，皇帝任命军官为马尼普，授予他们一定的军衔和土地称为“伊克塔”或“扎米”。马尼普的职责是招募和维持一定数量的士兵，并在战时带领他们作战。士兵的数量和质量会直接关系到马尼普的军衔和收入。
内务部间谍司分析认为这种制度确保了莫卧儿皇帝能够迅速动员大量军队，且这些军队还拥有相对不错的军事素质。
其二，军事种姓制度。莫卧儿帝国的军队中，高等级的军官通常来自拉杰普特等传统的战士种姓。这些军官因其军事技能和家族背景而受到尊重。他们的忠诚和勇气是帝国军事力量的重要组成部分。
内务部间谍司分析认为这一制度某种程度上类似于明军将领的亲兵家丁制，只不过在这里，“将领”是莫卧儿皇帝，“家丁”则是这些战士种姓出身的人。
其三，雇佣军。间谍司通过打探和汇总情报，发现除了本土士兵外，莫卧儿帝国还广泛使用雇佣军。其中最著名的是来自中亚的突厥人和阿富汗的帕坦人，他们在帝国的骑兵部队中占据重要地位。此外，皇帝阿克巴还建立了一支由非洲奴隶组成的精锐步兵部队，称为“巴克特什”。