古往今来，世界上绝大部分组织，包括政党、部队都采用了“层级管理”制度。因为这个制度有两个突出的优点：权责分明，程序规范。也就是说，层级制度规定了“谁对谁负责；谁向谁请示汇报”。凡是不按照这个规程进行的活动，都属于越级指挥。当然，在个别场合对同一项工作也可以由多层级、多部门进行分别汇报，以便高层领导详细了解情况。但这些都不是一般情况，不属于日常工作的流程。在正常情况下，我们每个人从进入单位的那一天就会被清楚地告知——你对谁负责、你要向谁报告。只有了解了这个工作的基本规则之后，我们才能正式开始工作。
为什么会有“越级指挥”？
既然级制度原则有利于组织加强统一指挥原则，保证了组织内信息联系的畅通。为何还会有越级指挥的现象产生呢？单位遇到重要、紧急工作必须动员所有人员完成，这时候就是按照“分工不分家”原则来调兵遣将，没有什么该不该、行不行、好不好的问题了，关键是要立即高质量完成上级交办的任务。
有些科室人员因为出差、抽调、培训等原因，导致暂时性人员紧缺，因此需要单位调配人员。
比如某科室的重要工作、复杂问题需其他科室协助解决的情况，或者某人有专门技能、特长，可以较好完成某项工作，因此在不占用太长时间的前提下，其他科室领导请求该人员过来协助。
行大事者不拘小节，有些领导不重视这些小问题，比如你的位置刚好在办公室门口，就叫你去复印份文件，去其他部门取份资料、通知某人参会等等。这些占用时间短、完成难度低的任务吩咐谁去做，效果都差不多。为精简繁琐程序，提高工作效率，没有必要拘于层级管理制度的约束。
一般情况下，越级指挥并不会对单位、对个人产生影响。但如果领导频繁地进行越级指挥，就会产生不良影响。
是会增加下属的额外负担。各科室人员一般根据工作需要和各人能力特长进行分工，虽责任有轻重，事务有多寡，但基本能保持相对平衡。领导越级指挥将会使得个别人员负担加重，破坏科室内平衡。
影响下属的岗位职责。有些年轻的朋友在往往没有留意到这一点，接到越级指挥之后，干劲十足，将自己本身的岗位职责抛在脑后，殊不知这样极易引起直接上司、同部门同事产生一些不必要的误会。
会恶化下属的人际关系。试想一下，原本你负责给领导写讲话稿、报告的，如果你的上级领导忽然开始直接叫你下属来负责了？你会怎么想？一些奇怪的想法和担忧是否在你脑海里挥之不去？是不是会忽然有本领恐慌的烦恼？
上级管理者可以随时随地的对下级的工作情况进行监督、检查，发现问题，只要不是特别紧急，不马上解决有可能酿成巨大损失，上级一般都不应越级向下发号施令，而是找到与此事有关的自己的直接下级，调查了解，弄清真相，双向沟通，寻找办法，然后向其下达解决问题的指示。至于你的指示是否需要向下传达，向谁传达，传达些什么内容，则完全由他自己来决定，作为上级领导你只要定期关注这个问题的改善情况就可以了。既然设定了这一级岗位，就要尊重这个岗位管理者的权益，发挥其主观能动性。如果你觉得这个层级影响了工作效率，那说明公司的组织结构出现了问题，可以对组织结构进行扁平化改造，取消这个多余的层级。如果是这个管理者没能力胜任，可以通过正常、正规的组织程序将其调离、撤换。在此之前，还是应该发挥该层级的作用。既然有这个和尚，你却替他来撞这个钟，首先对撞钟人是个伤害，同时也是对资源的浪费。其次，一个下级只能有一个直接上级，并对其负责。他从这个上级那里领受指示，接受监督，并将执行结果向其反馈。正是这种各司其责的体系，保证了部队的高效运转。
其实在现实的工作中，我们碍于情面，采取了默认的状态，觉得一家人不说两家话，都是一个团队，一个集体的，没什么大不了的。实则这样做对集体的长久发展来说，是弊大于利的，对自己的下属不管不问，任由别的部门直接指挥，甚至有时候图自己方便，直接把自己的工作职责交给下属，直接与别的部门进行联系，进行对接，这样的管理中层就是在作茧自缚，早晚会自食其果。